O Regimento Interno da UNIFAP, através do seu Art. 6, normatiza os colegiados deliberativos na Administração Superior:
- Conselho Universitário (CONSU);
- Conselho Diretor (CONDIR);
A composição e competências dos colegiados da administração superior da UFRN estão definidas no Regimento Interno .
Todos os colegiados da UNIFAP possuem representação de todas as categorias de integrantes da comunidade acadêmica (discentes, servidores docentes e servidores técnico-administrativos).